chromosome conformation capture-chromatin immunoprecipitationclone 染色体构象捕获-染色体免疫沉淀-克隆技术(6C技术)

6C技术是在染色体构象俘获技术(3C技术)基础上,联合染色体免疫沉淀及克隆等技术,可对有限数目长染色质之间是否存在相互作用这一定性问题进行研究。3C技术主要经过甲醛交联、限制性酶切、稀释和连接、解交联、DNA纯化与PCR鉴定。通过一对分别与选定的2段DNA配对的引物进行PCR扩增,通过PCR产物的有无、产量的高低等,就可以对是否存在相互作用进行判断。染色质免疫沉淀技术的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片段的纯化与检测,获得蛋白质与DNA相互作用的信息。6C技术与3C技术类似,但是包含了染色质免疫沉淀(ChIP),从而降低了染色质池的复杂性。不过由于该技术需要将复制出的片段固定于细菌内,并需要通过限制性酶切及凝胶电泳检测复制出的DNA,因此仍然费时费力。参见3C技术。